quando un utente viene cancellato, viene anche tolto dalla protezione dei file.
se un file è protetto solo per quell'utente, il file diventerà sprotetto e perciò non chiederà + il login.
ho appena controllato questa cosa con l'ultima versione stabile disponibile (2.0a) e tutto ha funzionato liscio.
probabilmente hai fatto qualche errore tu, o forse il browser stava usando la cache.
se invece scopri che c'è un bug, scrivi la procedura esatta su come farlo succedere, così lo faccio anch'io sul mio pc e poi l'aggiusto.